(记者衣晓峰 通讯员宁尚伟)哈尔滨医科大学生物信息学院院长李霞教授及其团队在肿瘤大数据研究领域取得了系列新进展。他们全面整合和挖掘了肿瘤生物医学大数据资源,从系统层面深入阐释了不同分子导致肿瘤发生发展的奥秘,锁定了新的肿瘤生物标志物,开发了新的评估和检测肿瘤治疗反应的大数据平台,最终为肿瘤防治和机理研究提供了肿瘤大数据支持和信息发掘的方法学参考。其系列论文陆续发表于国际著名学术期刊《神经肿瘤学》《肝脏病学》《核酸研究》。相关成果前不久还获得2019年教育部自然科学奖二等奖。
李霞团队成功鉴别了约600例低阶胶质瘤和胶质瘤母细胞瘤病人的突变克隆状态,在克隆进化水平上解析了性别之间的差异;同时,揭示了女性胶质瘤病人携带更高的整体和亚克隆突变负荷,辨识了呈现出克隆性性别差异的著名癌基因,如CDH18基因和ATRX基因,以及胶质瘤的各个亚型、性别间显现出的突变负荷和癌基因的克隆性差异。研究提示,胶质瘤临床用药应考虑性别这一重要因素。
另一项研究中,李霞教授团队与美国德州大学奥斯汀分校专家合作,发现了癌细胞选择性的靶向“脆弱性”基因,以扰乱参与癌症功能的蛋白-RNA互相作用。基于受干扰的RNA结合蛋白和靶基因的表达,两国专家还识别出具有不同生存率的三种肝癌亚型,为研究肝癌中体细胞突变扰动蛋白-RNA的调控网络和揭开癌症中基因型与表型关系,提供了有价值的资源及独到见解。
此外,李霞教授团队还开发了多个界面友好、功能强大、适合于科研人员使用的肿瘤生物医学大数据平台与分析软件。其中,他们发表在《核酸研究》杂志上的最新版本数据库,是全球最大的肿瘤相关长链非编码RNA数据库.目前访问量已近12000次,并被评为高被引论文。
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