目前清洗饮水机内胆所采用的比较普遍的方法是用去污泡腾片或专用消毒剂。目前各大超市均有此类产品出售，价格也不贵。
清洗的方法如下：
第一步：拔去电源插头，取下水桶，打开饮水机后面的排污管口（一般为白色塑料材质的旋钮），排净余水。然后，再打开冷热水开关放水。

第二步：取下“聪明座”（就是饮水机内接触矿泉水桶的部分），用酒精棉仔细擦洗饮水机内胆和盖子的内外侧，为下一步消毒做准备。
第三步：按照去污泡腾片或消毒剂的说明书配置消毒水，导入饮水机，使消毒水充盈整个腔体，留置10~15分钟。
第四步：打开饮水机的所有开关，包括排污管和饮水开关，排净消毒液。
第五步：用清水连续冲洗饮水机整个腔体（这个过程建议把饮水机搬到卫生间里，保证水量充沛），打开所有开关排净冲洗液体。
第六步：放一杯水，闻闻有没有氯气味。如有，再放水，一直到闻不出任何气味才可以放心地喝。
专家建议，至少2个月清洁一次饮水机，夏季应该每个月清洗。