遗传因子组成相同如AA,aa人们则习惯称为纯合子，也称纯合体，同型综合子或者同型结合体，纯合子往往指的是那些同一位点上的两个等位基因相同的基因型个体。相同的纯合子间交配所生后代不出现性状分离。

就所研究的若干基因而言，其具有相对关系的全部基因在机能和位点上都相同的接合体称为纯合子。根据遗传定律，我们可以知道相同的纯合子间交配所生后代不出现性状分离。

即纯合子就是指自交后代不发生性状分离的个体，因此AABB，AAbb，aaBB，aabb都是纯合子。需要引起注意的是基因型如AAbb类的物种虽然是纯合子，但我们不能单纯的说是显性纯合子或者隐性纯合子，因为它既有隐性基因也有显性基因。

习惯上，人们将纯合子分为显性纯合子和隐性纯合子两类。其中显性纯合子是指同源染色体上同一基因座上的两个等位基因完全相同显性基因的个体。而隐性纯合子则是指同源染色体上同一基因座上的两个等位基因完全相同隐性基因的个体。由此看来，基因型如AAbb类的物种既不属于显性纯合子，也不属于隐形纯合子。

一对相对基因如果存在有AA和aa两种基因型的个体，二对相对基因则有AABB，AAbb，aaBB，aabb四种基因型的个体。这种状态称为同型。根据遗传定律，原则上纯合子不会由于自交而分离出具有不同遗传因子的个体，因而纯合子可以用这种方法加以确定。