为使消毒工作顺利开展并取得好的消毒效果．一定要根据实际情况选择合适的方法。在选择消毒方法时应从以下3个方面去考虑。
(1)病原微生物的种类 不同的病原微生物对各种消毒处理的耐受性也不一样，如细菌芽孢对大多数消毒因子耐受力比其他微生物强得多，只有使用热力处理或灭菌剂才能取得较好的效果。结核杆菌对热力消毒很敏感，面对某些消毒剂的耐受力却比其他细菌繁殖体强得多。肠道病毒对过氧乙酸的耐受力与细菌繁殖体相似，但季铵盐类消毒剂却无效。
〔2)消毒对象的性质 同样的消毒方法对不同性质的物品效果也不一样。对表面光滑的墙面，药物小易停留，使用药物擦拭或气溶胶喷雾效果好，粗糙表面以普通喷雾处理即可。使用环氧乙烷气体熏蒸消毒时，对易于吸收药物的材料如布料、纸张效果较好；对于不吸收环氧乙烷的表面如金属等需时较长。对空气、物体表面、地面、餐饮具、水、排泄物等不同的消毒对象要选用不同的消毒方法和消毒药械。
另外。还要考虑消毒方法对处理刘象的损害问题，如高浓度过氧乙酸或含氯消毒剂浸泡棉织品、金属器械可损害处理对象。
(3)现场特点 消毒现场的密闭性、水泥等直接影响到选用何种消毒方法。例如，在水源丰富的地区，可用喷洒消毒；在缺水地区，可直接喷洒消毒药粉。对于物体表面消毒，密闭性能好的可使用熏蒸消毒法，密闭性能差的，使用液体消毒剂喷洒或擦拭。对于空气消毒，通风条件好而外界空气又清洁的地区，可以利用自然换气法；通风不良的，可使用熏蒸或气溶胶喷雾处理。
